Perakaran tanaman durian cenderung tumbuh ke bawah. ujung akar terdiri dari sel-sel muda yang selalu membelah dan merupakan titik tumbuh akar. sel-sel itu sangat lembut dan mudah sekali rusak, ujung akar tertutup oleh tudung akar yang terdiri atas sel-sel pelindung. Tudung ini dinamai tudung akar ( calyptra), yang bagian luarnya berlendir sehingga dapat menembus tanah.
Tudung akar bagian luar cepat aus (rusak), tetapi didalamnya senantiasa tumbuh sel-sel baru. Dibelakang titik tumbuh terletak bagian luar yang berbentuk kulit luar, dibawah kulit luar tersebut terdapat kulit pertama dan di tengah-tengah terdapat pusatnya.